Trots varningar, bland annat från den adelsman från Skåne med kanske störst inflytande, Tage Ottesen Thott, förklarar Frederik III Sverige krig 1657. Planeringen från dansk sida är synnerligen bristfällig och kriget slutar bekant året efter med att östra Danmark går förlorat till Sverige. Skåne och Blekinge, tillsammans med Halland, försäkras sina juridiska, kyrkliga och borgerliga rättigheter vid freden i Roskilde.
Vid Roskildefreden 1658 uppskattas befolkningen i Skåneland till cirka 280 000 invånare.
- Halland - 58 000
- Skåne - 180 000
- Blekinge - 32 000
- Bornholm - 15 000
Nitton år senare, år 1697 har befolkningen minskat till 260 000, eller -3%. År 1718, när nästa folkuppskattning görs (svårt att kalla det för folkräkning) är befolkningstalet nere i 213 200, en katastrofal minskning med 21% under en tid då befolkningsökningen var markant i hela Europa.
Minskningen hade naturligtvis med de ständiga krigen att göra; dels lär cirka 15 000 skånelänningar, främst skåningar och en del hallänningar, ha flytt över till Sjælland, dels så skrevs skånelänningar ut till svensk krigstjänst:
- 1660 - 1699: ca 12 000 man
- 1700 - 1713: ca 18 000 man
Svenskarna använde de ständiga krigen som ett sätt att bli av med framför allt den uppstudsiga skånska befolkningen. Av Karl XII:s ca 60 000 man starka svnska krigsmakt utgjorde skånelänningarna hela 36%, eller 22 000 man! Ett ytterligare exempel var det skånska rytteriet, räknat som ett elitförband i Danmark, som efter att ha hamnat under svensk krona aldrig tjänstgjorde i Skåneland utan i Pommern och i Ingermanland.
1648-1650 Stränga vintrar följda av somrar med ihärdigt regnande så att åkrarna inte kunde besås skapade hungersnöd. Speciellt Halland blev drabbat. Sverige förbjöd import av spannmål från Danmark.
Kriget slutar med en katastrof för regionen. Den blir delad! Bornholm hade avstått till Sverige 1658, men tack vare det lokala motståndet lyckades bornholmarna föra ön tillbaka till Danmark. Som lokal hjälte räknas bland annat Jens Kofoed som stod i spetsen av upprorer mot den svenska ockupationen. Men, avklippt från det övriga Skåneland blir Bornholm isolerat och försvinner snart på dagordningen i København. Först med nya trafikförhållanden, där Öresundsbron spelar stor roll, och skapandet av Region Skåne har ett mer intensivt samarbete mellan Bornholm och Skåne påbörjats.